Actualmente, la Virgen de Juquila es la tercera imagen mariana más venerada de México, sólo después de la de Guadalupe y San Juan de los Lagos. Además, se considera la segunda patrona de Oaxaca, siendo la primera la Virgen de la Soledad. Se calcula que anualmente visitan el templo 2, 5 millones de personas, lo que lo vuelve el sexto santuario del país.
Debido al gran amor que tienen sus fieles, suelen llamarla “Juqui” o “Juquilita”. El 13 de febrero de 2014, el Papa Francisco concedió la coronación de la imagen.